在浸种催芽过程中，时常出现因操作不当造成种子发酸发臭，出芽不好等问题。所以在浸种催芽时应注意：

1．晒种：浸种前一周选晴天将种子晒3―4小时或半天，然后将晒好的种子放在干燥、阴凉的地方，有利于提高种子发芽率和发芽速度；晒种也可杀死部分附着在稻壳上的病菌。在竹匾或泥地上晒种较好，但不能直接把稻种摊在水泥地板或石板上晒，以防晒伤稻种。

2．选种：将种子倒入清水中，把浮在表层的秕粒和病粒捞出，选用饱满的稻种，以培育出整齐健壮秧苗。同时将种子在水中搅拌，清洗掉附着在种子上的杂质和病菌，之后将种子捞出以备浸种。

3．浸种消毒：采取“日浸夜露”法浸种（白天浸种，夜间捞出），即早饭后将清洗后的种子放在清水中浸泡，到晚饭后将种子捞出；第二天早饭后再将种子放入用300倍强氯精药液浸种并消毒，消毒药液应高出种子表面一寸，12小时后将种子捞出用清水反复将残留在种子上的药液冲洗干净（如不消毒也可直接用新换的清水浸种），然后捞起催芽。

4．催芽：不能将种子装在透气性差的编织袋或塑料袋中催芽，甚至因为温度上不来，将种子放在太阳下暴晒，往往造成烧芽。种子数量较多时一般采取常温催芽较为安全，最好的方法是在地面垫一层无病稻草，将湿润的麻袋或多层透气性较好的编织袋铺在稻草上，把种子均匀地铺在上面，再用湿润的麻袋盖或多层透气性较好的编织袋盖在上面，中途注意适当洒些温水保持稻谷湿润，待种子自然破胸露白后即可播种。也可将种子装入麻袋或箩筐中，四周用稻草封好保温。谷种升温后，控制温度在35℃左右，温度过高要翻堆，特别注意防止中心温度过高造成烧芽，过低则可撒些温水提高温度，一般经20小时左右，谷种即可露白破胸。

5．炼芽：催芽结束后要把催好芽的谷种摊开在常温下炼芽3―6小时后再播种。使谷种适应空气温度，提高成苗率。